犬在繁殖后代的過程中，可以說數量多少是依賴于母犬而質量好壞則取決于公犬。因此，所謂種犬的選擇，實際上是指為母犬選擇配種的公犬，并不存在為公犬選擇母犬的問題。至于選擇什么樣的個體做為種犬飼養，則屬于育種以及品種標準的范疇。
為母犬選擇配偶，首要的條件是注意公犬有無遺傳病（如單睪，畸形等），因為這會直接影響所產后代的“成品率”。其次，要避免與母犬有近親關系，因為支配遺傳病的多為隱性基因，遠親交配可以使其永遠處于潛伏狀態而不表現，近親交配因公母雙方攜帶相同隱性基因的機會多，生出畸形后代的機會也就多。此外，近親交配所產生后代的生命力弱，不易成活。
如果母犬體型或外貌上存在某種缺點，不可指望用有相反缺點的公犬交配以求后代有所改正。例如，母犬為凹背不可用凸背公犬配，而只能用正常公犬配種才可能得到正常的后代。再如，“X”型腿的母犬也不能用“O”型腿的公犬來校正。
在確定交配使用的公犬之前，應了解其近期的交配受胎成績。如果公犬已經很長時間沒配種，其體內的精子有很多已老廢，使用這樣的公犬必須交配兩次以上才能得到可靠的受胎率。
此外，要在母犬交配日的前幾天便與公犬主預約并談好代價和條件。
