在母藏獒出現發情征兆后，就要著手選擇一條優良的公獒作其配偶，公獒的品質將直接關系到下一代獒仔的優劣，要選擇無退化現象，神經類型穩定，體質健壯，生長發育快抗病力和繁殖能力都強的藏獒。配種的最佳時機應在母獒陰部流血后的12-13天間。
這時母獒開始排卵，生殖道已為交配做好了準備，母獒也表現出愿意交配的征兆，如陰門充分腫脹甚至外翻，分泌物的量減少并且由開始時的血樣粘液逐漸變成淺色或不見血，如用手按壓母獒腰部或扶按尾部，則站立不動，尾巴抬起偏向一側，陰部頻頻開閉。遇公獒則頻頻排尿，表示愿意接近公獒，讓公獒嗅其陰部，接受公獒爬跨，有是還爬跨公獒，表現越來越強的行為。見上面這些征兆后，要盡快讓其交配。
一定要在母藏獒交配欲最強，發情征兆最明顯時交配。配種次數以兩次為好，即初配和復配。兩次相隔距離的時間以24-48小時為宜，以免影響胎兒的發育。交配的地點最好是在母獒生活的地方，不要多人圍觀，以免在交配過程中收到驚嚇，影響交配。交配時以自然方法為主，輔以人工幫助方法。交配時，要注意不要刺激藏獒，注意安全。
當公藏獒松脫后，會各自舔陰部，不可馬上牽拉軀干，尤其是公獒，在交配后常會出現腰部凹陷，俗稱“掉腰子”切不可讓其劇烈運動。交配后也不可讓其馬上飲水，應休息片刻，活動一會再讓其飲水。交配時間，夏季最好在清晨或傍晚，冬季則以中午交配唯宜。交配前最好不要喂食或不要喂得過飽，以免因食后立即交配而引起嘔吐。
