家貓的眼睛顏色變化很多，有藍色、綠色、黃色、橙色和棕色。而這里面的每一種顏色都有由淺至深的色調變化。這些顏色的過渡不是間斷的，而是連續的。
眼睛怎么出現的顏色呢
有兩種主要的原因產生了貓科動物的眼睛顏色。虹膜色素沉淀和藍光反射。
虹膜的色素沉淀是由黑色素導致的，并且顏色排列從檸檬黃到淡褐色到深橙色或是棕色。另外“透明的”眼睛結構，晶狀體這個也象一塊玻璃一樣反射外來的光線。如果從正面看，玻璃是沒有顏色的，但是我們慢慢移動角度會看到它呈綠色或是藍色。同樣的，貓科動物眼睛的透明結構也呈透明的藍色深淺排列從無色到很深的藍色或象紫羅藍那種藍色。這種藍色光線反射的顏色組和加上虹膜色素沉淀所產生的顏色構成了貓所有的眼睛顏色。
虹膜色素沉淀和透明結構色素都是由染色體上不同位置的多個多基因控制的。同窩的小貓從父母那里混合地繼承了這些多基因并且產生了不同的眼睛顏色。不同的多基因混合導至顏色深淺的排列。
幼貓出生的時候都是藍眼睛。成貓的眼睛顏色定型于六七周大的時候，但是也有到三四個月大的時候眼睛顏色才固定下來。在一只貓的一生當中疾病和傷害能夠導致眼睛顏色的變化，但給貓吃魚會讓貓的眼睛改變顏色這種說法是無稽之談，這是因為在給貓斷奶的時候，由于人們給小貓喂魚，在商業貓糧產生之前，大家可能都是喂的魚給小貓吃，然而恰恰這個時候正是小貓的眼睛顏色變化的時候。
藍色系列
幼貓出生時是藍眼睛的，但這并不是他們一生都不變的眼睛顏色，在幾個少數品種當中藍眼睛是永遠不變的，但是在大多數的品種當中，將會在六周之后會被另一種顏色所替代。藍色的深淺取決于藍色光線反射的強度。
藍眼睛是重點色貓的一個特征，這種貓的眼睛顏色與隨溫白化病相關，這產生了重點色的圖案。藍眼睛的色調亮度的變化，使繁育者們必須有選擇的采用這個品種當中最好的眼睛顏色的貓來繁育，從而能夠產生更理想的藍眼睛重點色幼貓。
藍眼睛也發生在純白色貓當中或是結合了顯性純白色基因的貓當中。但這種情況和白化病是截然不同的。因為白色顯性基因只是罩住了身體潛在的顏色。如果白斑在眼睛周圍出現的話，會影響眼睛色素。白貓可能有一只或是兩只都是藍眼睛。而非藍眼的白貓的眼睛顏色可以是品種標準當中的任何一種顏色。
舉例來說：一只單只藍眼的白波斯貓的另一只眼睛的顏色是燦爛的橙色。在任意的鴛鴦眼白貓當中非藍眼的眼睛顏色可以是綠色或是黃色甚至是有點藍色的陰影。
Ojos Azules西班牙語為藍眼睛，是一個新貓種，藍眼睛、但非重點色和非純白貓——譯注被歸為矢車菊藍色、淺藍色眼睛，但是這種突變與致命殘疾因子相連。如果一只幼貓得到了雙份XY或是XX染色體上都的這種突變基因。在這個品種中眼睛顏色與被毛顏色無關。其它突然出現的藍眼睛突變也與被毛顏色無關。
綠色和淺綠色
綠色排列從微黃的綠色到醋粟綠色到更深的綠色和藍色調的綠色。一些更老的標準上叫做草綠色眼睛，指非常非常的綠。綠顏色或是綠斑點有時候也會出現在淺褐或棕色眼睛里。
金吉拉波斯和它的短毛品種~異短，因為他們的帶黑色眼線的深綠色眼睛而倍受注目。淺綠藍綠被發現在東奇尼貓眼睛上，它的體形及顏色/圖案介于暹邏貓和緬甸貓之間。暹邏貓有藍色的眼睛而緬甸貓有橙色的眼睛。
黃色、橙色/琥珀和棕色
黃色系列包括從淡檸檬色到更鮮艷的色調。這種交迭也出現在黃色和棕色，淡褐色或是棕褐色之間以及黃色和綠色之間。
黃色和綠色的界限也許不太清晰，但不會被誤認為是橙色眼睛的貓。橙色眼睛常常被描述為銅色。很多品種的發展歸功于早期的英國貓愛好者所做的努力，他們把它叫做橙色，因為黃色和淡綠色無法界定，而亮橙色也出現在被毛的顏色中。
棕色包含了很寬的范圍，從淡褐色正常的野生白貓的眼睛顏色到黑棕色。一些棕色眼睛會出現綠色黃色或是橙色的顏色或是斑點。
鴛鴦眼~異色癥
在貓當中鴛鴦眼是指一只眼睛是藍色的，另一只眼睛是其它顏色的。
鴛鴦眼是最常見的白顯性貓，一只眼睛是藍色的，而另一只眼睛是黃色、橙色棕色或是綠色的。
血統貓鴛鴦眼白貓有一只藍眼一只橙色/琥珀色眼睛，但在隨意繁殖時非藍眼的那只眼睛可能是黃色、綠色或是棕色。一些白貓有兩只藍眼睛，但是在照相時閃光燈讓一只眼睛反射出綠色，而另一只眼睛反射出紅色。這是由于眼睛結構不一樣造成的。高白的雙色貓在正面拍照的時候也可能反射出鴛鴦眼。
不太常見的，其它顏色的貓也有有鴛鴦眼。舉例來說：一只玳瑁有一只黃色眼睛和一只藍色眼睛。這是因為眼睛在胚胎階段發育不同而形成的。也許這只貓有白斑基因，但可能不會顯示在被毛顏色上而影響到了眼睛。
有時候不同眼睛顏色是由于眼睛受傷或是疾病造成的。這些原因傷害了虹膜或是一只眼睛。在這種情況下這種特征不會被遺傳。
兩色眼睛~單眼雙色
兩色眼睛表示一只眼睛的虹膜有兩種顏色。舉例來說：也許一個黃色的虹膜環繞著一個綠色的虹膜。在貓展當中，這被認為是一個錯誤，但是他卻會很吸引人。
舉例來說：一只棕色區域出現在一個藍色或是綠色的眼睛當中。一些白貓被報告出有這樣的眼睛。只有一部分虹膜受色素的影響另一部分受到了白斑基因的影響。一只或是兩只眼睛都能夠被影響如果兩只眼睛都受到了影響可能會出現鏡反像效果。這種情況有時候被叫做“怪眼”貓，因為他們不是常見的鴛眼。
粉紅
粉紅不是一個正常的貓眼睛顏色。這是基于粉紅眼睛的白化病原因和眼睛色素完全缺乏造成的，并且伴有極少的藍光反射。真正的白化病沒有一點黑色素，并且虹膜是淡粉紅白色。由于藍色的反射眼睛通常有一點藍色，產生藍色眼睛的白化病效果。非常罕見的透明結構無色的和粉紅眼睛的白化病效果。
因為眼睛的結構，曾經相信不可能會有粉紅色眼睛的貓，而且真正的白化病會有淡藍的眼睛，但現在已經有幾只粉紅眼睛白化病的貓在最近幾年被報告出來。白化病癥已經記錄在加拉貓和它的野生雙親當中——亞洲美洲豹貓
