貓眼睛顏色改變是由于瞳內虹膜色素的改變，導致的眼睛顏色的變化。貓眼睛的顏色都是由于虹膜上色素的顏色決定的，虹膜色素變化就會導致我們看到貓眼睛的顏色出現變化；虹膜色素沉淀和藍光反射決定了貓的眼睛顏色。
貓長大后眼睛顏色改變由黑色素決定
首先，虹膜色素沉淀和藍光反射決定了貓科動物的眼睛顏色。
虹膜的色素沉淀是由黑色素導致的，并且顏色排列從檸檬黃到淡褐色到深橙色或是棕色。另外 “透明的”眼睛結構(晶狀體——我認為是這個)也象一塊玻璃一樣反射外來的光線。如果從正面看，玻璃是沒有顏色的，但是我們慢慢移動角度，會看到它呈綠色或是藍色。同樣的，貓科動物眼睛的透明結構也呈透明的藍色，深淺排列從無色到很深的藍色或象紫羅藍那種藍色。這種藍色光線反射的顏色組和加上虹膜色素沉淀所產生的顏色構成了貓所有的眼睛顏色。
貓的是通過基因遺傳
虹膜色素沉淀和透明結構色素都是由染色體上不同位置的多個多基因控制的。同窩的小貓從父母那里混合地繼承了這些多基因并且產生了不同的眼睛顏色。不同的多基因混合導至顏色深淺的排列。
純種貓的兩只眼睛顏色是一樣的，鴛鴦眼一般認為是雜種所致。這種貓（中國臨清貓或土耳其安卡拉貓）多數有遺傳缺陷，藍眼睛非常漂亮，耳朵卻是聾的。所以人們用黃眼睛白貓跟這種貓雜交，繁育出鴛鴦眼，一只黃、一只藍眼睛的白色長毛貓，就沒有耳聾的缺陷了。
貓的眼睛顏色變化出現在6-7周
小貓出生時，一般身長為11-15厘米，體重為70至135克。新生小貓眼睛尚未睜開，耳朵反摺，所以既看不見也聽不見。小貓發育的第一個進展是，5-10天開始睜眼;8-12天眼睛才能完全睜開。眼睛的顏色通常為灰藍色，大約在六到七周大時，這種早期的顏色開始變化，藍膜會褪去，逐漸定型，但是也有到三四個月大的時候眼睛顏色才固定下來。在一只貓的一生當中，疾病和傷害能夠導致眼睛顏色的變化。
給貓喂魚并不能改變顏色
給貓吃魚會讓貓的眼睛改變顏色這種說法，是無稽之談!這是因為，在給貓斷奶的時候，由于人們給小貓喂魚（在商業貓糧產生之前，大家可能都是喂的魚給小貓)吃，然而恰恰這個時候，正是小貓的眼睛顏色變化的時候，所以才出現了這個誤區）。
基本上，小時候虹膜天藍色或者淺藍色的，大了還是藍色;小時候虹膜藍灰色，大了以后不太會出現藍色，但是是黃色還是綠色或者黃綠說不定，終歸于它原本的品種應有的眼色素。
